华大基因科技服务有限公司科技专家 到我园进行科研合作交流

发布时间:2018-06-11

华大基因科技服务有限公司科技专家

到我园进行科研合作交流

 

68日,应我园科学研究部邀请,华大基因科技服务有限公司黄锦群、王松波等4名专家到我园通报华南虎基因组研究进展、解读动物基因组研究报告,并就华南虎基因组学标准化分析后进一步的研究、濒危野生动物宏基因组学研究技术及动物肠道微生物的研究动态进行深入探讨。

华南虎基因组学研究是我园科研团队主持开展的科研项目。以我园雄性华南虎团团和雌性华南虎“欢欢作为基因组测序对象,使用长读序的三代de novo技术辅助二代测序进行修正。初步的研究结果表明,华南虎的基因组约为2.4G,测序深度超过50×,基因的杂合度较低,组装质量非常高,使用HIC技术,可以组装到染色体水平,为后续开展猫科动物的遗传进化、群体遗传多样性评估、功能基因的注释与鉴定、特有基因及遗传病基因的定位与挖掘打下坚实的基础。随着肠道微生物高通量测序技术的成熟,宏基因组学研究技术结合宿主基因组学及代谢组学研究技术,可以深入理解和研究濒危野生动物的免疫水平、代谢机理、疾病发生机制、消化及生殖生理现象等科学问题。华大基因科技服务有限公司的研究专家以穿山甲、大熊猫、川金丝猴、大型猿类的肠道微生物研究案例为例,详细分析论文的研究思路、项目的研究方案设计、采样要求、数据挖掘及论文撰写等环节,与我园研究团队就肠道微生物研究项目开展的研究难点、研究方案的创新、研究数据的分析与应用等问题进行长时间的、深入和热烈的讨论,并在华南虎、云豹、金猫、长臂猿、灰叶猴等动物基因组学研究、肠道微生物研究方面达成初步的合作意向。

1:华南虎基因组的K-mer分析图

2:华南虎基因组的组装结果统计

3:华大基因科技专家与我园领导及研究人员交流

4:动物肠道微生物研究案例分析